Samsun Ticaret ve Sanayi Odası Genel Sekreteri, Oda çalışanlarının idari amiridir.

5174 Sayılı kanun, kararname, tüzük ve yönetmelikler çerçevesinde Oda’nın işlem ve yazışmalarını idari hiyerarşinin en üstünde yer alan Genel Sekreter idare eder. Oda tarafından verilecek belgelerin tanzim edilmesini ve bu belgelerin hazırlanması için gerekli bilgilerin toplanmasını sağlar. Bütçe taslağının hazırlanmasını sağlama ve Yönetim Kurulunun onayına sunulmasından sorumludur. Bina ve demirbaşlarının korunması için gerekli çalışmaları yaptırmak, müdürlüklerin verimli ve yeterli hizmet vermelerini sağlamak Genel Sekreterin sorumluluk alanına girmektedir. Oda personeli ile ilgili atama, yükselme, ödüllendirme, cezalandırma ve özlük işleri gibi konular Genel Sekreter tarafından yürütülmektedir. Samsun Ticaret ve Sanayi Odası Genel Sekreteri Yönetim Kuruluna karşı sorumludur ve Yönetim Kurulu kararlarının uygulanmasının organize edilmesi Genel Sekreterin sorumluluğu altındadır.

Samsun Ticaret ve Sanayi Odası Genel Sekreterine bağlı 3 tane Genel Sekreter Yardımcısı bulunmaktadır ve Genel Sekreter tarafından yardımcılar arasında bir görev dağılımı yapılmıştır.